IRES 与 circRNA 翻译小谈

俗话说：物以稀为贵。在“茫茫环海”中找到一个能够翻译的 circRNA 将是一件多么有趣的事。

我们都知道，经典的翻译要依赖于m7G帽子结构，而环状的结构让 circRNA 只能通过非经典的方式启动翻译，包括通过 IRES（Internal Ribosome Entry Site）介导 circRNA 的翻译起始。目前已证实一些 circRNA 翻译是由 IRES 介导的，包括：

circRNA	IRES	Publish
circFBXW7	YES	10.1093/jnci/djy118
circMbl	YES	10.1016/j.molcel.2017.02.021
circZNF609	YES	10.1016/j.molcel.2017.02.021
circSHPRH	YES	10.1038/s41388-017-0019-9
circβ-actin	YES	10.1186/s13059-019-1685-4
circLINC-PINT	YES	10.1038/s41467-018-06862-2

值得注意的是，circBank 中预测到大量 circRNA 是包含 IRES 元件的，另外，之前提到的数据库 IRESbase 最近正式发表在 Genomics, Proteomics & Bioinformatics，它所收集的实验证实包含 IRES 结构的 circRNA 也不少 —— 人类中包含了 691 个。感谢宋晓峰教授团队为我们提供了一个很棒的数据库，让我们能够更方便地探索 circRNA IRES 调控机制，更多详细的结果请访问网址：

http://reprod.njmu.edu.cn/cgi-bin/iresbase/index.php。

在已证实的 circRNA 中，有一个 circZNF609，我们都知道辛脂蛋白家族非常庞大，据统计有越 700~900 个基因都能编码辛脂蛋白。我非常好奇是否还包含其他辛脂蛋白基因编码的 circRNA 也包含 IRES。通过 IRESbase 搜索 ZNF，我发现除了 ZNF609 还包含许多其他辛脂蛋白基因，并且每个基因能够编码的包含 IRES 的 circRNA 数量非常巨大，例如 ZNF410。

这是否说明其他辛脂蛋白相关 circRNA 也能够翻译呢？

另外一个 circLINC-PINT 来自非编码的 lncRNA，这也非常有趣，说明可翻译的 circRNA 并不遵守已定义的 CCDS 规则。为此，我浏览量了一下 IRESbase，发现除了该 lncRNA，还有另外几个非编码的基因，包括：

• lncRNA MGC16025

• 假基因 CASP12 和 GUCY1B2

当然，关于 IRES 介导 circRNA 肯定还有很多故事，如果大家对 circRNA 翻译非常感兴趣，也可以参加我们的课程。

期刊介绍

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 是由中国科学院主管、中国科学院北京基因组研究所和中国遗传学会主办的英文期刊，2018~2020 的影响因子分别是 6.615, 6.597 & 7.051。

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